Nasce come struttura adibita solo al traffico militare. Intorno agli anni 60, lo scalo viene aperto anche ai voli "civili" soprattutto a quelli Alitalia, che collegavano Bari con Roma, Catania, Palermo, Ancona e Venezia.
Alla fine degli anni 70, l'aeroporto viene rinnovato completamente e nel 1990 in occasione dei Mondiali di Calcio viene ingrandita ulteriormente l' aerostazione con conseguente allungamento della pista. E' previsto tuttavia ancora un incremento: la superfice complessiva si svilupperà fino a 29.000 mq, suddivisi fra terminal, uffici e aree commerciali.
Ridenominato Karol Woytila , l' aeroporto di Bari si candida come punto di riferimento per il sud d'Italia nel traffico aereo anche low cost.
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